Illumina推出StrataMap，一张芯片即可绘制组织内基因表达的“三维地图”
基因测序服务提供商Illumina， Inc．（纳斯达克股票代码：ILMN）今日正式宣布推出StrataMap空间解决方案。这是一款端到端的、基于测序技术的空间转录组学研究平台，旨在以前所未有的广度和分辨率，重新定义研究人员在空间背景下探索全转录组的能力。
StrataMap空间解决方案此前被称为Illumina空间解决方案。它提供了一个集成的完整工作流程，使科学家能够在单细胞分辨率下，对7.5平方厘米捕获区域内的大块组织切片进行无偏倚的全转录组分析。与基于探针panel的替代技术相比，StrataMap基于测序的方法每个样本能检测到的基因数量多出一倍，并且能够发现非编码基因和假基因中隐藏的信号。
该平台在通量、速度及可及性方面均设立了新标准。StrataMap每年可处理超过2000个样本，测序最短仅需22小时，从样本到数据洞察的全过程可在五天内完成。更重要的是，它能够无缝集成到现有的组织病理学工作流程中，并在Illumina NovaSeq和NextSeq平台上运行，为客户提供了一个易于进入空间生物学领域的入口。
在生物信息学支持方面，StrataMap配备了DRAGEN和Illumina Connected Multiomics软件。DRAGEN StrataMap流程通过机器学习驱动的细胞分割和转录本分配简化空间探索，而Connected Multiomics平台则通过交互式数据驱动分析，支持将转录组数据与基因组、表观组和蛋白质组数据整合。
早期使用该平台的研究人员已取得重要成果。贝斯以色列女执事医疗中心（BIDMC）的研究团队利用StrataMap绘制了人类淋巴集合管图谱，并构建了三维组织模型。英国癌症研究剑桥研究所及剑桥大学的研究团队则在原发性中枢神经系统肿瘤上成功测试了该平台，其研究涵盖胶质瘤和胶质母细胞瘤组织，为精准手术和个性化治疗提供了新思路。
StrataMap空间解决方案于本月起正式开放订购，主要面向发育生物学、神经科学及肿瘤学等研究领域。目前该解决方案支持新鲜冷冻组织样本，适用于真核生物组织。此外，Illumina正在积极开发适用于福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）组织的特异性解决方案，预计将于2027年向初始客户开放使用。
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